办公室：协调市社机关的政务工作，协助市社领导处理日常事务；负责市社综合性文秘工作；负责综合性会议的会务；负责公文办理、政务公开、信息宣传、机要保密、文书档案、目标管理、信访维稳、应急管理、社会治安综合治理、对外联系、公务接待和机关后勤服务工作。

人力资源管理科：承办党组的日常工作；指导全市系统联合社机关建设；指导全市系统人才、教育和培训工作；指导全市系统法制建设；负责全市系统政风行风建设，指导合作社文化建设；负责机关和市直系统并协管行业的内保工作；负责机关机构编制、组织人事、劳动工资、社会保险等工作；负责市直系统离休干部和机关离退休人员的管理服务工作。

 财会统计科：执行国家有关财务、会计、审计、财政、税务、信贷的政策法规；指导全市系统财会和审计工作；负责管理各类专项资金和财产；负责市本级国有资产监管；负责机关经费管理；负责市本级统计工作，指导全市系统统计工作；承办全市系统经济绩效考核工作。

社有经济发展科：负责市本级并指导全市系统社有企业改革发展工作；负责市本级并指导全市系统社有资产管理工作，落实市社理事会在企业中的出资人代表职责，监督指导社有企业经营活动；负责市本级并指导全市系统安全生产管理工作；负责市本级并指导全市系统防灾减灾和救灾工作。

合作经济指导科：负责全市系统发展战略和发展规划的研究制订；指导全市系统改革发展工作；指导全市系统基层社、农民专业合作社、专业（行业）协会和合作经济联合组织建设；指导全市系统消费、金融、保险等新型合作组织建设；发展农村电子商务。

综合业务科：指导全市系统实施“新网工程”，构建农资、农产品、日用工业品、再生资源等现代流通服务网络；指导全市系统开展农产品市场体系建设，推进农业产业化经营；指导全市系统开展农村社会化服务体系建设；指导全市系统健全农资现代经营服务体系，落实重要农资商品储备制度，保障农资有效供给；指导全市系统拓展经营服务及社办工业、科技应用工作；负责全市系统项目管理工作；负责招商引资及重点投资项目建设工作；负责市本级并指导全市系统整顿规范市场经济秩序工作。

监事会办公室：负责监事会日常工作；负责起草监事会的有关文件；负责了解并反映各监事会成员对供销合作社的意见和建议；负责组织监事会的调查研究，督导成员社对理事会相关制度的执行情况；组织有关部门监督检查社有资产的保值增值，维护供销合作社合法权益；负责指导协调全市供销社系统监事会工作。

机关党委办公室：承办直属机关党委的日常工作和所属支部的党建工作；负责机关和市直系统的党群、纪检工作；组织开展机关思想政治工作和精神文明建设；负责帮扶救助等社会工作。